时间:2020-07-21 13:46:00 浏览:28456次
荧光定量PCR(也称TaqMan
PCR,以下简称FQ-PCR)是美国PE(Perkin Elmer)公司1995年研制出来的一种新的核酸定量技术,该技术是在常规PCR基础上加入荧光标记探针来实现其定量功能的,与变通PCR相比,FQ-PCR具有许多优点。与普通PCR相比,FQ-PCR具有许多优点:1、封闭反应,无需PCR后处理。2、特异性强,灵敏度高。3、采用对数期分析,摒弃终点数据,定量准确。4、定量范围宽,可达到10个数量级。5、仪器在线式实时检测,结果直观,避免人为判断。6、可实现一管双检或多检。7、操作安全,缩短时间,提高效率。荧光定量 PCR是 通过对 PCR 扩增反应中每一个循环产物荧光信号的实时检测从而实现对起始模板定量及定性的分析。
荧光定量PCR分类:
☆TaqMan荧光探针
PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5‘-3‘外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。
☆SYBR Green荧光染料
SYBR
Green是一种DNA结合染料,能非特异地掺入到双链DNA中去。在游离状态下,它不发出荧光,但一旦结合到双链DNA中以后,便可以发出荧光。它的最大优点就是可以与任意引物、模板相配合,用于任意反应体系中。从经济角度考虑,它也比其它的探针的价格要便宜得多。但由于它能与所有的双链DNA结合,所以一旦反应体系中出现非特异扩增,那它就会影响到定量结果的可靠性与重复性。要避免这种不利因素,可以通过选择良好的引物并优化反应条件以消除非特异性影响。
●主要实验步骤如下:
RT-qPCR是由三个步骤组成:
1.反转录:依赖反转录酶将RNA反转录成cDNDA;
2.扩增:用PCR的方法扩增cDNA;
3.检测:实时检测和定量扩增的产物.
具体实验操作步骤:
1.设计并合成Realtime PCR引物。
2.引物溶解后使用Promega的TaqDNA聚合酶进行含SG(SYBR®; Green)的PCR反应的优化。
3.客户样品RNA抽提
实验对象为组织样品,取适量(50-100mg)新鲜组织样品或正确保存的组织样品加1ml的RNA抽提试剂Trizol(Invitrogen),匀浆后抽提RNA。
实验对象为细胞样品,每份样品取1×106~1×107细胞,PBS清洗细胞,去PBS加1ml的RNA抽提试剂Trizol(Invitrogen),裂解后抽提RNA 。
4.RNA质量检测
a.紫外吸收测定法测定RNA在分光光度计260nm和280nm处的吸收值,以计算其浓度并评估RNA纯度 。
b.使用ambion公司的甲醛电泳试剂进行变性琼脂糖凝胶电泳,检测RNA纯度及完整性。
5.使用逆转录酶(Promega)进行反应,将样品RNA逆转录为cDNA。
6.制备标准曲线样品:
进行相对定量,需要先将样品的目的基因以及管家基因进行PCR扩增,其产物进行梯度稀释用于做标准曲线。
7.标准曲线样品和待测样品分别加入到含SG的RealTime PCR反应液中,进行RealTime
PCR扩增和检测。
8.检测结果进行标准曲线分析:以对待测样品的目的基因进行定量。相对定量实验需要进一步用样品的目的基因测得值除以管家基因测得值以校正误差,所得结果代表某样品的目的基因相对含量。
9.提供实验报告:包括详细的实验方法及实时荧光定量PCR实验结果的相关图表 。
荧光定量PCR中的一些术语
1.CT值:荧光信号有统计意义显著增长(即穿过阈值线)时的循环次数,或者说是从基线到指数增长的拐点所对应的循环次数。
2.阈值:阈值的默认设置是3-15个循环的荧光信号的标准偏差的10倍。
3.CT值与起始模板的量成线性关系。
客户须知:
1、请您提供新鲜的且尽量多的材料,或直接提供纯化好的总RNA或DNA(大于5ug/样本)。如是如织:100-200mg
2、请通过EMAIL提供已知的全长基因序列。
3、请提供详细背景资料:DNA/RNA来源,丰度。
结果提供:
1、实验详细步骤,和相关数据。
2、标准曲线,扩增曲线,溶解曲线。
3、完整的实验报告(含软件分析结果)
威斯腾服务流程:
十、威斯腾生物服务项目:
分子生物学检测 | 蛋白质与免疫学 | 动物实验 |
实时荧光定量PCR | 单克隆抗体制备 | 帕金森疾病模型 |
免疫共沉淀(Co-IP) | 多克隆抗体制备 | 抑郁症动物模型 |
ELISA(酶联免疫吸附法)技术 | Western-blot 实验服务 | 脊髓损伤模型 |
生化指标检测 | 蛋白双向电泳实验服务 | 脑外损伤模型 |
双荧光素酶报告基因检测 | 原核蛋白表达纯化 | 骨神经损伤模型 |
染色质免疫共沉淀(ChIP) | 真核蛋白表达纯化 | 心肌缺血模型 |
GST pull Down | ITRAQ定量蛋白质组学 | 心力衰竭模型 |
SLAC蛋白组学 | 肺动脉高血压动物模型 | |
高血压模型 | ||
病毒包装纯化 | 实验课题整体外包 | 粥样动脉硬化模型 |
过表达/干扰慢病毒包装纯化 | 整体课题外包 | 大脑中动脉阻塞模型 |
过表达/干扰腺病毒包装纯化 | 细胞整体实验外包 | 慢性之气管炎模型 |
逆转录病毒包装纯化 | 动物整体实验外包 | 过敏性哮喘模型 |
腺相关病毒包装纯化 | 肺炎大鼠模型 | |
肝炎-肝硬化-肝癌模型 | ||
蛋白芯片 | 原代细胞培养 | 肝纤维化模型 |
细胞因子芯片 | 骨髓间充质干细胞培养 | 胆结石模型 |
生长因子芯片 | 脂肪干细胞培养 | 急性胰腺炎模型 |
信号通路磷酸化水平检测芯片 | 心肌成纤维细胞培养 | 急性肾衰竭模型 |
BioPlex悬浮芯片 | 软骨细胞培养 | 体内血栓模型 |
生长因子芯片 | 血管内皮细胞培养 | 关节炎模型 |
炎症因子芯片 | 神经元细胞培养 | I型和II型糖尿病模型 |
血管生成因子芯片 | 内皮组细胞原代培养 | 裸鼠成瘤 |
凋亡因子芯片 | 基因编辑动物 | |
趋化因子芯片 | 电生理相关服务 | 动物整体实验服务 |
HuProt TM 20K人类蛋白组芯片 | 膜片钳实验 | |
细胞生物学 | 高通量测序 | 代谢组学 |
细胞原代培养 | mRNA测序 | 气相色谱GC/MS |
MTT检测 | LncRNA测序 | 液相色谱LC/MS |
细胞凋亡检测 | 全基因组测序 | 核磁共震NMR |
细胞周期检测 | RNA-Seq测序 | |
细胞克隆形成实验 | 外显子测序 | 影像学相关实验 |
Transwell细胞迁移/侵袭 | 16s扩增子测序 | Micro-CT |
流式分选 | Small RNA测序 | 小动物活体成像 |
CCK8/XTT检测 | 宏基因组测序 | 核磁共振 |
台盼蓝检测细胞活性 | 单细胞测序 | PET-CT |
药物筛选细胞学实验 | circleRNA测序 | |
细胞粘附性检测 | 甲基化测序 | 基因编辑动物 |
细胞划痕实验 | 条件性敲除小鼠/大鼠 | |
细胞生物学整体实验 | 全基因敲除小鼠/大鼠 | |
细胞成管实验 | ||
病理学检测 | CRISPR/Cas9细胞敲除/敲入 | 基因芯片 |
扫描电镜 | 基因定点突变细胞系 | LncRNA芯片 |
透射电镜 | 单基因敲除细胞系 | miRNA芯片 |
HE染色 | 多基因敲除细胞系 | mRNA芯片 |
免疫组化 | 目的基因敲入细胞系 | 甲基化芯片(限人和小鼠来源样本) |
Tunel(原位末端凋亡法)检测 | 报告基因敲入细胞系 | SNP芯片(限人和小鼠来源样本) |
激光共聚焦 | miRNA/LncRNA敲除细胞系 | |
免疫荧光 | ||
Masson染色 | CRISPR/Cas9动物敲除/敲入 | |
原位杂交 | 基因敲除大鼠/小鼠 | |
荧光原位杂交 | 基因敲入大鼠/小鼠 | |
特殊染色(PSA、茜素红、阿尔新蓝等) | ||
行为学检测 | 药物筛选服务项目 | 药效学评价 |
水迷宫实验 | 高通量自动药物筛选平台 | 神经系统药物药效学评价 |
旷场实验 | 细胞高内涵药物筛选平台 | 抗肿瘤药物药效学评价 |
重复性刻板行为检测 | 蛋白质组学靶标研发平台 | 心血管系统药物药效学评价 |
动物跑台检测 | 分子药理研究平台 | 泌尿系统药物药效学评价 |
强迫游泳 | 生物膜片钳药物筛选平台 | 内分泌系统药物药效学评价 |
常规药物体外筛选 | 抗炎免疫药物药效学评价 |
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