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基因组/代谢组学
CHIP-seq

时间:2020-07-21 15:08:00 浏览:1750次


ChIP-seq采用特异性抗体对目的蛋白进行免疫沉淀后,分离与其结合的基因组DNA片段,并通过高通量测序,在全基因组范围内寻找目的蛋白特异结合的DNA位点,且可基于多个样品进行差异比较分析及特异蛋白结合位点的序列偏好性分析。

技术路线


案例分析

案 例:雌激素受体结合异常与乳腺癌临床试验的相关性研究
雌激素受体(ER)可与相关基因结合形成复合体并移位到细胞核结合下游基因激活它们转录,为肿瘤生长助力。在许多乳腺患者体内,就是因为该受体影响了基因的功能,从而引发致癌连锁反应。现在常用的他莫昔芬等乳腺癌治疗药物,就是通过阻断雌激素受体对基因的作用而发挥效果。但在不少患者身上,这种药物的效果并不理想。本研究基于高通量平台的染色质免疫共沉淀技术ChIP-seq全基因组范围内寻找ER 结合位点,从而鉴定雌激素结合模式是否在患者肿瘤中存在差异。

 图1鉴定出的抗他莫昔芬(tamoxifenER结合位点富集分析

威斯腾生物服务项目


分子生物学检测 蛋白质与免疫学 动物实验
实时荧光定量PCR 单克隆抗体制备 帕金森疾病模型
免疫共沉淀(Co-IP) 多克隆抗体制备 抑郁症动物模型
ELISA(酶联免疫吸附法)技术 Western-blot 实验服务 脊髓损伤模型
生化指标检测 蛋白双向电泳实验服务 脑外损伤模型
双荧光素酶报告基因检测 原核蛋白表达纯化 骨神经损伤模型
染色质免疫共沉淀(ChIP) 真核蛋白表达纯化 心肌缺血模型
GST pull Down ITRAQ定量蛋白质组学 心力衰竭模型

SLAC蛋白组学 肺动脉高血压动物模型


高血压模型
病毒包装 实验课题整体外包 粥样动脉硬化模型
过表达/干扰慢病毒包装纯化 整体课题外包 大脑中动脉阻塞模型
过表达/干扰腺病毒包装纯化 细胞整体实验外包 慢性之气管炎模型
逆转录病毒包装纯化 动物整体实验外包 过敏性哮喘模型
腺相关病毒包装纯化
肺炎大鼠模型


肝炎-肝硬化-肝癌模型
蛋白芯片 原代细胞培养 肝纤维化模型
细胞因子芯片 骨髓间充质干细胞培养 胆结石模型
BioPlex悬浮芯片 脂肪干细胞培养 急性胰腺炎模型
生长因子芯片 心肌成纤维细胞培养 急性肾衰竭模型
炎症因子芯片 软骨细胞培养 体内血栓模型
血管生成因子芯片 血管内皮细胞培养 关节炎模型
凋亡因子芯片 神经元细胞培养 I型和II型糖尿病模型
趋化因子芯片 内皮组细胞原代培养 裸鼠成瘤
HuProt TM 20K人类蛋白组芯片
基因编辑动物

电生理相关服务 动物整体实验服务

膜片钳实验
细胞生物学检测 高通量测序 代谢组学
细胞原代培养 mRNA测序 气相色谱GC/MS
MTT检测 LncRNA测序 液相色谱LC/MS
细胞凋亡检测 全基因组测序 核磁共震NMR
细胞周期检测 RNA-Seq测序
细胞克隆形成实验 外显子测序 影像学相关实验
Transwell细胞迁移/侵袭 16s扩增子测序 Micro-CT
流式分选 Small RNA测序 小动物活体成像
CCK8/XTT检测 宏基因组测序 核磁共振
台盼蓝检测细胞活性 单细胞测序 PET-CT
药物筛选细胞学实验 circleRNA测序
细胞粘附性检测 甲基化测序 基因编辑动物
细胞划痕实验
条件性敲除小鼠/大鼠
细胞生物学整体实验
全基因敲除小鼠/大鼠
细胞成管实验

病理检测 CRISPR/Cas9细胞敲除/敲入 基因芯片
扫描电镜 基因定点突变细胞系 LncRNA芯片
透射电镜 单基因敲除细胞系 miRNA芯片
HE染色 多基因敲除细胞系 mRNA芯片
免疫组化 目的基因敲入细胞系 甲基化芯片(限人和小鼠来源样本)
Tunel(原位末端凋亡法)检测 报告基因敲入细胞系 SNP芯片(限人和小鼠来源样本)
激光共聚焦 miRNA/LncRNA敲除细胞系
免疫荧光

Masson染色 CRISPR/Cas9动物敲除/敲入
原位杂交 基因敲除大鼠/小鼠
荧光原位杂交 基因敲入大鼠/小鼠
特殊染色(PSA、茜素红、阿尔新蓝等)

行为学检测 药物筛选服务项目 药效学评价
旷场实验 高通量自动药物筛选平台 抗肿瘤药物药效学评价
重复性刻板行为检测 细胞高内涵药物筛选平台 心血管系统药物药效学评价
动物跑台检测 蛋白质组学靶标研发平台 泌尿系统药物药效学评价
强迫游泳 分子药理研究平台 内分泌系统药物药效学评价

生物膜片钳药物筛选平台 抗炎免疫药物药效学评价

常规药物体外筛选

【本平台合作项目】
分子生物学、细胞生物学、基因敲出/入、模式动物、SPF动物保种、病理学检测、免疫学检测、影像学检测、原代培养、细胞药筛、CRISPR/Cas9基因编辑、基因芯片、高通量测序、蛋白组学、代谢组学、高通量高内涵筛选、药效学评价、药理毒理学实验、慢病毒包装与稳转株建立、SiRNA与纳米载药、ChIP、CO-IP、生物信息学分析、知识产权服务! 
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