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基因组/代谢组学
质谱分析/脂质组学分析

时间:2020-07-17 17:21:00 浏览:544次


质谱分析

中国生命科学实验技术服务联盟引进美国安捷伦公司的液相色谱质谱联用仪。形成了高通量、高灵敏度和高分辨率的规模化蛋白质分析支撑技术体系,为促进蛋白质组学及相关研究的发展,共享先进的技术资源,近年来生物质谱实验室蛋白质/多肽质谱鉴定、生物工程药物结构确证和蛋白质组学多项成熟的分析技术已为国内外客户提供了广泛的服务。

设备仪器:

美国安捷伦公司Agilent (xct-6330) 型号的液相色谱仪,MS为美国热电公司的TSQ型号质谱仪;质谱仪采用ESI(电喷雾电离)离子源,MS/MS 串连四极杆分析器。可在线检测极性有机化合物、核酸、多肽、小分子蛋白质及其化学修饰产品的实际分子量,并对送检样品进行分子量鉴定,纯度及修饰效果分析。

质量范围M/Z 10~2,000 分辨率R=2M

测试范围:
多肽、蛋白质的电喷雾质谱分子量测定以及天然产物分子、生物大分子、有机分子的质谱测试和研究

送检样品要求:样品应尽量不含盐份、离子表面活性剂、去垢剂及一些难挥发性盐。样品送检量、溶解方式以及未知可否做质谱检测的样品可与我们的工作人员联系以便提高检测效率。

(送样单请附带检测样品的品名及精确计算分子量)

送样须知:

A:样品量:50pmol干粉或1ug/uL以上(一般测试)、100pmol干粉或1ug/uL以上(MALDI串联质谱分析)、100ug干粉以上(二硫键分析、糖基化分析,***酸化分析,其他修饰分析)、10ug干粉以上(SDS-PAGE或IEF);

B:盐含量:挥发性无机盐,<20mM,请勿使用PBS、SDS和尿素等质谱干扰物质;

C:考马斯亮蓝染色样品可全部接收,银染过程中不得使用戊二醛作为固定剂;

D:请告知样品是否有修饰,并请注明修饰方式。

主要应用 :

* 蛋白质组学研究 * 寡聚糖和糖蛋白的研究 * 小分子化合物分析

* 药物发现和研发 * 食品和环境样品分析

检测报告:

从收到样品起1-2个工作日内可给出样品的检测报告,以电子邮件的形式发给您并附带检测结果分析。包括结果有:一级质谱:质谱图、肽段分子量、数据库检索结果; 二级质谱:质谱图、肽段分子量、数据库检索结果、肽段氨基酸序列、修饰位点等。


脂质组学分析

对脂类的准确鉴定和绝对定量在脂质代谢的综合研究中起着重要的作用。基于稳定同位素标记内标(SIL-IS)及响应因子(RF)建立的脂质组全定量库,可对Plasmenyl-glycerophosphatidylcholine(pPC)、Lysoglycerophosphatidylcholine(LPC)和Sphinganine(Sph)等多达34类脂质进行准确定性以及绝对定量。相较于传统的脂质组学检测方法需要添加 多种SIL-IS的弊端,我们通过引入RF使得我们的脂质组全定量方法,在保持与传统方法相当定量精度以及日间重复性的基础上,可定性定量物质种类更多、通量更高。通过对我们包含76361种脂质、181300张MS/MS二级质谱图的自建脂质二级质谱库的检索匹配,我们可以仅用单个SIL-IS,对生物样本种数万种脂质同时进行准确定性以及绝对定量,且上述工作均基于计算机程序自动化运作,高效便捷。

技术优势

脂质检测效率高:可实现单一SIL-IS同时高通量定性,绝对定量上万种脂质;

专业团队检测分析:通过计算机程序自动化运行。

样本要求

植物组织 200-500 mg

动物及临床组织标本 200 mg

血清、血浆 200 μL

微生物、细胞 1×107 cells

生物学重复

样本数量:植物和微生物n≥6,动物样本n≥10,临床样本n≥30,所有重复样本独立分析。

检测平台

UHPLC-QTOF-MS(Agilent 1290 UHPLC-AB 6600/5600 MS)

UHPLC-QE-MS(Agilent 1290 UHPLC-Thermo Q Exactive Focus/Plus/HF)

检测范围

pPC、LPC、Sph、Cer、SM、Cer-p、PhytoSph和HexCer等34类脂质

应用方向

1、通过分析各种代谢性疾病的不同代谢途径的脂质成分变化,揭示出相关疾病发生、发展过程中脂质成分的功能和影响;

2、通过比较不同处理,生物样本中脂质成分的差异,探究脂质成分的生物学功能。


威斯腾实验服务流程



威斯腾生物服务项目

分子生物学检测 蛋白质与免疫学 动物实验
实时荧光定量PCR 单克隆抗体制备 帕金森疾病模型
免疫共沉淀(Co-IP 多克隆抗体制备 抑郁症动物模型
ELISA(酶联免疫吸附法)技术 Western-blot 实验服务 脊髓损伤模型
生化指标检测 蛋白双向电泳实验服务 脑外损伤模型
双荧光素酶报告基因检测 原核蛋白表达纯化 骨神经损伤模型
染色质免疫共沉淀(ChIP 真核蛋白表达纯化 心肌缺血模型
GST pull Down ITRAQ定量蛋白质组学 心力衰竭模型
SLAC蛋白组学 肺动脉高血压动物模型
高血压模型
病毒包装 实验课题整体外包 粥样动脉硬化模型
过表达/干扰慢病毒包装纯化 整体课题外包 大脑中动脉阻塞模型
过表达/干扰腺病毒包装纯化 细胞整体实验外包 慢性之气管炎模型
逆转录病毒包装纯化 动物整体实验外包 过敏性哮喘模型
腺相关病毒包装纯化 肺炎大鼠模型
肝炎-肝硬化-肝癌模型
蛋白芯片 原代细胞培养 肝纤维化模型
细胞因子芯片 骨髓间充质干细胞培养 胆结石模型
BioPlex悬浮芯片 脂肪干细胞培养 急性胰腺炎模型
生长因子芯片 心肌成纤维细胞培养 急性肾衰竭模型
炎症因子芯片 软骨细胞培养 体内血栓模型
血管生成因子芯片 血管内皮细胞培养 关节炎模型
凋亡因子芯片 神经元细胞培养 I型和II型糖尿病模型
趋化因子芯片 内皮组细胞原代培养 裸鼠成瘤
HuProt TM 20K人类蛋白组芯片 基因编辑动物
电生理相关服务 动物整体实验服务
膜片钳实验
细胞生物学检测 高通量测序 代谢组学
细胞原代培养 mRNA测序 气相色谱GC/MS
MTT检测 LncRNA测序 液相色谱LC/MS
细胞凋亡检测 全基因组测序 核磁共震NMR
细胞周期检测 RNA-Seq测序
细胞克隆形成实验 外显子测序 影像学相关实验
Transwell细胞迁移/侵袭 16s扩增子测序 Micro-CT
流式分选 Small RNA测序 小动物活体成像
CCK8/XTT检测 宏基因组测序 核磁共振
台盼蓝检测细胞活性 单细胞测序 PET-CT
药物筛选细胞学实验 circleRNA测序
细胞粘附性检测 甲基化测序 基因编辑动物
细胞划痕实验 条件性敲除小鼠/大鼠
细胞生物学整体实验 全基因敲除小鼠/大鼠
细胞成管实验
病理检测 CRISPR/Cas9细胞敲除/敲入 基因芯片
扫描电镜 基因定点突变细胞系 LncRNA芯片
透射电镜 单基因敲除细胞系 miRNA芯片
HE染色 多基因敲除细胞系 mRNA芯片
免疫组化 目的基因敲入细胞系 甲基化芯片(限人和小鼠来源样本)
Tunel(原位末端凋亡法)检测 报告基因敲入细胞系 SNP芯片(限人和小鼠来源样本)
激光共聚焦 miRNA/LncRNA敲除细胞系
免疫荧光
Masson染色 CRISPR/Cas9动物敲除/敲入
原位杂交 基因敲除大鼠/小鼠
荧光原位杂交 基因敲入大鼠/小鼠
特殊染色(PSA、茜素红、阿尔新蓝等)
行为学检测 药物筛选服务项目 药效学评价
旷场实验 高通量自动药物筛选平台 抗肿瘤药物药效学评价
重复性刻板行为检测 细胞高内涵药物筛选平台 心血管系统药物药效学评价
动物跑台检测 蛋白质组学靶标研发平台 泌尿系统药物药效学评价
强迫游泳 分子药理研究平台 内分泌系统药物药效学评价
生物膜片钳药物筛选平台 抗炎免疫药物药效学评价
常规药物体外筛选

【本平台合作项目】
分子生物学、细胞生物学、基因敲出/入、模式动物、SPF动物保种、病理学检测、免疫学检测、影像学检测、原代培养、细胞药筛、CRISPR/Cas9基因编辑、基因芯片、高通量测序、蛋白组学、代谢组学、高通量高内涵筛选、药效学评价、药理毒理学实验、慢病毒包装与稳转株建立、SiRNA与纳米载药、ChIP、CO-IP、生物信息学分析、知识产权服务!
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